泉州摄影家陈世哲先生1987年曾拍摄过一张图为清净寺发掘的场面。不过清净寺礼拜大殿原先到底有无屋顶，当年地面发掘没有定论，考古史学界至今仍说法不一。

　　寺内有闽南风格建筑

　　如今，清净寺内建筑尽是伊斯兰风格，惟独明善堂是闽南风格建筑，这是为何？

　　黄秋润介绍说，明善堂原是中阿混合建筑风格，由于拱形圆顶的古礼拜大殿塌毁，凡遇一些礼拜，则把同为朝拜方向的明善堂，改为穆斯林礼拜安拉的场所。

　　至于为何会变成闽南风格，他猜测，或许是几经重建，加上捐资人财力也有限度，只好跟着本地的建筑特色走。

　　明善堂倒毁后，在清嘉庆年间，由福建全省陆路军务漳州总镇马建纪捐资重建，这时变成了中国传统古建筑四合院形式。

　　又经过几十年风雨侵袭，岌岌欲塌时，同治十年，福建全省陆路军务提督江长贵捐俸重建为闽南古民居特色的小三间建筑形式。

　　１９５０年，明善堂塌毁。

　　１９９８年，按“修旧如旧”原则重建明善堂，恢复清同治年间建筑的原貌，也就是闽南古民居特色的小三间建筑形式。

　　寺门楼顶为“望月台”

　　清真夕照，是泉州古代著名的景致之一。

　　走过涂门街，抬头可看到清净寺入口的门楼顶部，有一个回字形的垛子，好似城堞。这就是当年有名的“望月台”。望月台不单名字好听，它还对应着一种古习俗，真用来望月的。

　　黄秋润会长告诉记者，历史上，望月台上有伊斯兰教风格的尖塔，美轮美奂，如今则是光秃秃的了。此外，望月台边还曾有过望月亭，可惜也消失了。

　　据介绍，每年有一个月的斋月，要进行封斋与开斋。时间临近的时候，清净寺里有身份的“阿訇”、长老等会登上望月台上望新月，细心地在天空中寻找月牙儿，来决定具体哪一天封斋或哪一天开斋，并形成了一种习俗，如今也还保留着。每年，泉州的穆斯林看日历估计时间到了，就会习惯性地打电话到清净寺问日子定了没。